临床兽医实验室位于新中心实验楼一层，由实验室和准备室两部分组成，可容纳学生30人。临床兽医实验室承担着动物医学专业、动物科学专业和畜牧兽医专业的《兽医临床诊断学》、《兽医内科学》、《兽医外科学》、《兽医产科学》、《兽医卫生检验》、《细胞生物学》、《小动物疾病学》、《宠物饲养与保健美容》、《家畜环境卫生学》、《动物普通病》等专业基础或专业课程的实验实习教学。

   实验室现有专职教师5名，其中教授1名，副教授1名，讲师3名，具有硕士及以上学位的教师3名，基本上形成了一支人才充实、基础扎实、结构合理、方向明确、开放创新的教学和科研学术团队。

   近年来，本实验室先后承担完成了各级课题项目6项，其中有2项山东省教育厅基金项目：《高效抗流感病毒中草药方剂的研究》（负责人为蒋培红教授）、《猪链球菌病的综合防控技术研究》（负责人为蒋培红教授），和2项菏泽市科技局项目：《农区暖棚小尾寒羊肥羔生产关键技术研究》（负责人为蒋培红教授）、《济宁青山羊高繁品系繁育及标准化生产示范》（负责人为蒋培红教授）。共发表学术论文17篇，其中SCI收录1篇，A类学报1篇。科研成果获得菏泽市科技进步奖二等奖3个（《小肽对獭兔生长性能和免疫性能影响的研究》、《农区暖棚小尾寒羊肥羔生产关键技术研究》、《猪链球菌病的防控技术研究》），获得实用新型专利1项（一种羊用保定器）。

   主要的仪器设备有：电热恒温鼓风干燥箱、手术台、手术器械架、恒温数显不锈纲狗兔两用解剖台、冲卵管、移植枪、鼠兔解剖台、大动物手术台、超净工作台、不锈钢立式灭菌器、二氧化碳细胞培养箱、低速离心机、数显恒温水浴锅、超声波清洗机、加热磁力搅拌器、电动移液助吸器、酸度计等。