发酵工程实验室坐落于综合实验楼E321，是药学院的专业实验室。实验室面积为86.53平方米，实验室负责人为李秀芳，讲师。发酵工程实验室现用于科研实验室，负责药学院教师的科研工作。主要的实验设备有安捷伦高效液相色谱仪、东京理化旋转蒸发仪、东京理化薄膜旋转蒸发仪、真空干燥箱、鼓风干燥箱、莱玻特瑞立式振荡培养箱ZQPL-200、新芝超声波细胞粉碎仪、博迅净化工作台、植物组培室、离心机、超纯水机等；主要研究方向为新型药物载体及药物制剂的研究，共承担和参与项目17项，其中省部级科研项目7项（山东省自然科学基金面上项目2项）；市厅级社科项目2项；校级科研项目5项；校级大学生开放项目3项；指导学生参加校级及省级大学生创新创业项目10余项，其中获得第十三届“挑战杯”建设银行山东省大学生创业计划铜奖1项；“科巢杯”第九届山东省大学生医药生物技能大赛二等奖1项；第五届中国“互联网+”生态环境创新创业互联网大赛优秀奖1项；荣获第十八届“挑战杯”山东省大学生课外学术科技作品竞赛菏泽学院校内选拔赛一等奖1项、二等奖2项；校级创新大赛优秀奖1项、一等奖3项；实验室学生和老师共计发表科研论文20余篇，其中SCI收录15篇，授权发明专利2项，实用新型专利1项。
